Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sugt1Q9CX34 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sugt1Q9CX34 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sugt1Q9CX34 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sugt1Q9CX34 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sugt1Q9CX34 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms