Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Khdc3Q9CWU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Khdc3Q9CWU5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms