Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx2Q9CWK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx2Q9CWK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx2Q9CWK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms