Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC44.19■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Sycp2Q9CUU3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Sycp2Q9CUU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
Sycp2Q9CUU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Sycp2Q9CUU3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
Sycp2Q9CUU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Sycp2Q9CUU3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Sycp2Q9CUU3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
Sycp2Q9CUU3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Sycp2Q9CUU3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Sycp2Q9CUU3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
Sycp2Q9CUU3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Sycp2Q9CUU3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Sycp2Q9CUU3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Sycp2Q9CUU3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Sycp2Q9CUU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Sycp2Q9CUU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Sycp2Q9CUU3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Sycp2Q9CUU3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Sycp2Q9CUU3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Sycp2Q9CUU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC43.69■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms