Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl28Q9CR40 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhl28Q9CR40 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl28Q9CR40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl28Q9CR40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl28Q9CR40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl28Q9CR40 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl28Q9CR40 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl28Q9CR40 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl28Q9CR40 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl28Q9CR40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl28Q9CR40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl28Q9CR40 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms