Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd9Q9CR00 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd9Q9CR00 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd9Q9CR00 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms