Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PclafQ9CQX4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PclafQ9CQX4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PclafQ9CQX4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms