Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mri1Q9CQT1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mri1Q9CQT1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms