Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CQM1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CQM1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CQM1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CQM1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CQM1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CQM1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CQM1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CQM1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CQM1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CQM1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CQM1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CQM1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CQM1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CQM1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CQM1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQM1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CQM1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CQM1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQM1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQM1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQM1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQM1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CQM1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms