Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rwdd1Q9CQK7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rwdd1Q9CQK7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rwdd1Q9CQK7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rwdd1Q9CQK7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rwdd1Q9CQK7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms