Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nudt21Q9CQF3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nudt21Q9CQF3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nudt21Q9CQF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudt21Q9CQF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudt21Q9CQF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms