Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufa3Q9CQ91 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufa3Q9CQ91 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufa3Q9CQ91 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms