Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Ubl4bQ9CQ84 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ubl4bQ9CQ84 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Ubl4bQ9CQ84 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ubl4bQ9CQ84 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ubl4bQ9CQ84 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Ubl4bQ9CQ84 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Ubl4bQ9CQ84 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms