Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl49Q9CQ40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl49Q9CQ40 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mrpl49Q9CQ40 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms