Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ28

Dph6, Diphthine--ammonia ligase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph6Q9CQ28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dph6Q9CQ28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Dph6Q9CQ28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dph6Q9CQ28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dph6Q9CQ28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dph6Q9CQ28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dph6Q9CQ28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dph6Q9CQ28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dph6Q9CQ28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dph6Q9CQ28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dph6Q9CQ28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms