Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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2010109I03RikQ9CQ11 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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2010109I03RikQ9CQ11 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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2010109I03RikQ9CQ11 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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2010109I03RikQ9CQ11 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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2010109I03RikQ9CQ11 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2010109I03RikQ9CQ11 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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2010109I03RikQ9CQ11 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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2010109I03RikQ9CQ11 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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2010109I03RikQ9CQ11 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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2010109I03RikQ9CQ11 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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2010109I03RikQ9CQ11 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2010109I03RikQ9CQ11 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
2010109I03RikQ9CQ11 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
2010109I03RikQ9CQ11 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2010109I03RikQ9CQ11 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2010109I03RikQ9CQ11 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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