Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Commd4Q9CQ02 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Commd4Q9CQ02 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Commd4Q9CQ02 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Commd4Q9CQ02 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms