Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6cQ9CPQ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox6cQ9CPQ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox6cQ9CPQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox6cQ9CPQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms