Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bap1Q99PU7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bap1Q99PU7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bap1Q99PU7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Bap1Q99PU7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms