Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt23Q99PS0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt23Q99PS0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt23Q99PS0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt23Q99PS0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms