Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a5Q99NH7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a5Q99NH7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a5Q99NH7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a5Q99NH7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms