Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GsdmcQ99NB5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GsdmcQ99NB5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GsdmcQ99NB5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms