Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CalcbQ99MP3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CalcbQ99MP3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CalcbQ99MP3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms