Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PccbQ99MN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PccbQ99MN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PccbQ99MN9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PccbQ99MN9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PccbQ99MN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PccbQ99MN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms