Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SncaipQ99ME3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SncaipQ99ME3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SncaipQ99ME3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms