Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc5Q99LG4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc5Q99LG4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc5Q99LG4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc5Q99LG4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms