Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms