Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pacsin3Q99JB8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pacsin3Q99JB8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin3Q99JB8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms