Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxp3Q99JB6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxp3Q99JB6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxp3Q99JB6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxp3Q99JB6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms