Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dhx58Q99J87 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dhx58Q99J87 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dhx58Q99J87 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms