Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GhdcQ99J23 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GhdcQ99J23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GhdcQ99J23 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GhdcQ99J23 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GhdcQ99J23 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GhdcQ99J23 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GhdcQ99J23 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GhdcQ99J23 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GhdcQ99J23 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GhdcQ99J23 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms