Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim66Q924W6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim66Q924W6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim66Q924W6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim66Q924W6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms