Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrif1Q923B3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nrif1Q923B3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrif1Q923B3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms