Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
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