Protein–RNA interactions for Protein: Q920A5

Scpep1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scpep1Q920A5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scpep1Q920A5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scpep1Q920A5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scpep1Q920A5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scpep1Q920A5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms