Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncbQ91ZZ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncbQ91ZZ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms