Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg13Q91YI1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg13Q91YI1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg13Q91YI1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg13Q91YI1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms