Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha8Q91Y12 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha8Q91Y12 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha8Q91Y12 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdha8Q91Y12 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms