Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx11Q91WL6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx11Q91WL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx11Q91WL6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms