Protein–RNA interactions for Protein: Q91VZ6

Smap1, Stromal membrane-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap1Q91VZ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smap1Q91VZ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smap1Q91VZ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smap1Q91VZ6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smap1Q91VZ6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smap1Q91VZ6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smap1Q91VZ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Smap1Q91VZ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Smap1Q91VZ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smap1Q91VZ6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms