Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col26a1Q91VF6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col26a1Q91VF6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col26a1Q91VF6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col26a1Q91VF6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col26a1Q91VF6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col26a1Q91VF6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col26a1Q91VF6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col26a1Q91VF6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col26a1Q91VF6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col26a1Q91VF6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col26a1Q91VF6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms