Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RestQ8VIG1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RestQ8VIG1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RestQ8VIG1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RestQ8VIG1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RestQ8VIG1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RestQ8VIG1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RestQ8VIG1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RestQ8VIG1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RestQ8VIG1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RestQ8VIG1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms