Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ9

Kri1, Protein KRI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kri1Q8VDQ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kri1Q8VDQ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kri1Q8VDQ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kri1Q8VDQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kri1Q8VDQ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kri1Q8VDQ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kri1Q8VDQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms