Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1Q8VDF2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1Q8VDF2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1Q8VDF2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1Q8VDF2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1Q8VDF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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