Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sgip1Q8VD37 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sgip1Q8VD37 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Sgip1Q8VD37 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sgip1Q8VD37 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sgip1Q8VD37 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sgip1Q8VD37 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sgip1Q8VD37 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sgip1Q8VD37 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sgip1Q8VD37 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sgip1Q8VD37 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sgip1Q8VD37 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms