Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sgms1Q8VCQ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgms1Q8VCQ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sgms1Q8VCQ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sgms1Q8VCQ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sgms1Q8VCQ6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms