Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MpdzQ8VBX6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MpdzQ8VBX6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MpdzQ8VBX6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MpdzQ8VBX6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MpdzQ8VBX6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MpdzQ8VBX6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MpdzQ8VBX6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MpdzQ8VBX6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MpdzQ8VBX6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MpdzQ8VBX6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms