Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nae1Q8VBW6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nae1Q8VBW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nae1Q8VBW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nae1Q8VBW6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms