Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ClmpQ8R373 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmpQ8R373 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmpQ8R373 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmpQ8R373 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ClmpQ8R373 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms