Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gle1Q8R322 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gle1Q8R322 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gle1Q8R322 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gle1Q8R322 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms